MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Enterobacter aerogenes EA1509E plasmid pEA1509_B

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020182	AC	3	6	163	168	50 %	0 %	0 %	50 %	444324408
2	NC_020182	TTC	2	6	185	190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444324408
3	NC_020182	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444324408
4	NC_020182	CCG	2	6	320	325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324408
5	NC_020182	AAC	2	6	359	364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324408
6	NC_020182	TGGAA	2	10	417	426	40 %	20 %	40 %	0 %	444324409
7	NC_020182	ACG	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324409
8	NC_020182	ACCG	2	8	506	513	25 %	0 %	25 %	50 %	444324409
9	NC_020182	GCG	2	6	524	529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324409
10	NC_020182	ATG	2	6	624	629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324409
11	NC_020182	TGA	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324409
12	NC_020182	CCAGA	2	10	637	646	40 %	0 %	20 %	40 %	444324409
13	NC_020182	TAA	2	6	701	706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324409
14	NC_020182	CCA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324410
15	NC_020182	CCGG	2	8	802	809	0 %	0 %	50 %	50 %	444324410
16	NC_020182	CTG	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324410
17	NC_020182	CAG	2	6	837	842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324410
18	NC_020182	CCT	2	6	878	883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324410
19	NC_020182	T	6	6	926	931	0 %	100 %	0 %	0 %	444324410
20	NC_020182	CCA	2	6	1019	1024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324410
21	NC_020182	GCC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324410
22	NC_020182	A	6	6	1224	1229	100 %	0 %	0 %	0 %	444324411
23	NC_020182	TTA	2	6	1251	1256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444324411
24	NC_020182	GCT	2	6	1267	1272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324411
25	NC_020182	TGGATA	2	12	1296	1307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324411
26	NC_020182	GGA	2	6	1381	1386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444324411
27	NC_020182	ATTT	2	8	1416	1423	25 %	75 %	0 %	0 %	444324412
28	NC_020182	T	6	6	1421	1426	0 %	100 %	0 %	0 %	444324412
29	NC_020182	CCA	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324412
30	NC_020182	CGG	2	6	1443	1448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324412
31	NC_020182	TCC	2	6	1458	1463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324412
32	NC_020182	CTCA	2	8	1559	1566	25 %	25 %	0 %	50 %	444324412
33	NC_020182	ATC	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324412
34	NC_020182	ACC	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324412
35	NC_020182	CA	3	6	1672	1677	50 %	0 %	0 %	50 %	444324412
36	NC_020182	GTTCC	2	10	1697	1706	0 %	40 %	20 %	40 %	444324412
37	NC_020182	TCG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324412
38	NC_020182	TCA	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324412
39	NC_020182	CAC	2	6	1853	1858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324412
40	NC_020182	ATG	2	6	1887	1892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324412
41	NC_020182	TCC	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324412
42	NC_020182	AATA	2	8	1925	1932	75 %	25 %	0 %	0 %	444324412
43	NC_020182	AAC	2	6	1986	1991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324413
44	NC_020182	TGC	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324413
45	NC_020182	TCG	2	6	2412	2417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324413
46	NC_020182	ACGCC	2	10	2425	2434	20 %	0 %	20 %	60 %	444324413
47	NC_020182	GCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324413
48	NC_020182	CTGAC	2	10	2457	2466	20 %	20 %	20 %	40 %	444324413
49	NC_020182	CAG	2	6	2495	2500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324413
50	NC_020182	CCA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324413
51	NC_020182	CCG	2	6	2545	2550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324413
52	NC_020182	GCC	2	6	2560	2565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324413
53	NC_020182	CCG	2	6	2578	2583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324413
54	NC_020182	ATC	3	9	2704	2712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324414
55	NC_020182	CGC	2	6	2724	2729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
56	NC_020182	CTG	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324414
57	NC_020182	CCT	2	6	2919	2924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324414
58	NC_020182	CGG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324414
59	NC_020182	CGC	2	6	3022	3027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
60	NC_020182	GCC	2	6	3050	3055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
61	NC_020182	CAG	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
62	NC_020182	ATG	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324414
63	NC_020182	GC	3	6	3297	3302	0 %	0 %	50 %	50 %	444324414
64	NC_020182	T	6	6	3318	3323	0 %	100 %	0 %	0 %	444324414
65	NC_020182	TCG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324414
66	NC_020182	GCC	3	9	3373	3381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
67	NC_020182	CGC	3	9	3502	3510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
68	NC_020182	CTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324414
69	NC_020182	CGC	2	6	3562	3567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	444324414
70	NC_020182	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
71	NC_020182	CAG	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
72	NC_020182	GCG	2	6	3747	3752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324414
73	NC_020182	ACC	2	6	3782	3787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324414
74	NC_020182	TGG	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	444324414
75	NC_020182	TC	3	6	4035	4040	0 %	50 %	0 %	50 %	444324414
76	NC_020182	GCTG	2	8	4047	4054	0 %	25 %	50 %	25 %	444324414
77	NC_020182	CAG	2	6	4098	4103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
78	NC_020182	AGC	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
79	NC_020182	CAG	2	6	4135	4140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
80	NC_020182	CAGC	2	8	4161	4168	25 %	0 %	25 %	50 %	444324414
81	NC_020182	CCGC	2	8	4169	4176	0 %	0 %	25 %	75 %	444324414
82	NC_020182	GCA	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324414
83	NC_020182	TAA	2	6	4217	4222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324414
84	NC_020182	C	7	7	4294	4300	0 %	0 %	0 %	100 %	444324414
85	NC_020182	TAT	2	6	4422	4427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444324415
86	NC_020182	TCCG	2	8	4488	4495	0 %	25 %	25 %	50 %	444324415
87	NC_020182	GGC	3	9	4731	4739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324416
88	NC_020182	GTG	2	6	4750	4755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	444324416
89	NC_020182	CAC	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324416
90	NC_020182	GGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444324417
91	NC_020182	GGC	2	6	4860	4865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	444324417
92	NC_020182	CTGA	2	8	5504	5511	25 %	25 %	25 %	25 %	444324418
93	NC_020182	TCAG	2	8	5571	5578	25 %	25 %	25 %	25 %	444324418
94	NC_020182	ATC	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324418
95	NC_020182	ACC	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324419
96	NC_020182	GGT	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	444324419
97	NC_020182	T	6	6	6062	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	444324419
98	NC_020182	A	7	7	6096	6102	100 %	0 %	0 %	0 %	444324419
99	NC_020182	AAG	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444324419
100	NC_020182	AGG	2	6	6160	6165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444324420
101	NC_020182	AGA	2	6	6225	6230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444324420
102	NC_020182	A	6	6	6238	6243	100 %	0 %	0 %	0 %	444324420
103	NC_020182	ACCTTT	2	12	6264	6275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	444324420
104	NC_020182	ACCA	2	8	6478	6485	50 %	0 %	0 %	50 %	444324421
105	NC_020182	TTA	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444324421
106	NC_020182	CAT	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324421
107	NC_020182	CAC	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324421
108	NC_020182	T	6	6	6641	6646	0 %	100 %	0 %	0 %	444324422
109	NC_020182	ACCAT	2	10	6788	6797	40 %	20 %	0 %	40 %	444324422
110	NC_020182	ACC	4	12	6809	6820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324422
111	NC_020182	AAT	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324422
112	NC_020182	T	6	6	6932	6937	0 %	100 %	0 %	0 %	444324422
113	NC_020182	ATTTA	2	10	6947	6956	40 %	60 %	0 %	0 %	444324422
114	NC_020182	T	6	6	6974	6979	0 %	100 %	0 %	0 %	444324422
115	NC_020182	ATTC	2	8	7039	7046	25 %	50 %	0 %	25 %	444324422
116	NC_020182	ATTCTG	2	12	7085	7096	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	444324422
117	NC_020182	ATC	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324422
118	NC_020182	TGCCTC	2	12	7184	7195	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	444324422
119	NC_020182	CAG	2	6	7222	7227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324422
120	NC_020182	CAGCT	2	10	7304	7313	20 %	20 %	20 %	40 %	444324422
121	NC_020182	CT	3	6	7328	7333	0 %	50 %	0 %	50 %	444324422
122	NC_020182	AGC	2	6	7355	7360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324422
123	NC_020182	CTG	2	6	7370	7375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324422
124	NC_020182	TCC	2	6	7389	7394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444324422
125	NC_020182	CT	3	6	7461	7466	0 %	50 %	0 %	50 %	444324422
126	NC_020182	ACC	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324422
127	NC_020182	AAT	2	6	7544	7549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444324422
128	NC_020182	AC	3	6	7624	7629	50 %	0 %	0 %	50 %	444324422
129	NC_020182	CCA	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	444324422
130	NC_020182	GGCC	2	8	7683	7690	0 %	0 %	50 %	50 %	444324422
131	NC_020182	TGC	2	6	7707	7712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444324422
132	NC_020182	CAT	2	6	7835	7840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324422
133	NC_020182	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444324422
134	NC_020182	GCA	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324422
135	NC_020182	CAGC	2	8	7927	7934	25 %	0 %	25 %	50 %	444324422
136	NC_020182	AGGC	2	8	8008	8015	25 %	0 %	50 %	25 %	444324422
137	NC_020182	A	7	7	8461	8467	100 %	0 %	0 %	0 %	444324423
138	NC_020182	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324423
139	NC_020182	G	6	6	8607	8612	0 %	0 %	100 %	0 %	444324423
140	NC_020182	GTT	2	6	8623	8628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444324423
141	NC_020182	TGA	2	6	8653	8658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324423
142	NC_020182	GCA	2	6	8733	8738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
143	NC_020182	ACA	2	6	8882	8887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444324424
144	NC_020182	ATG	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444324424
145	NC_020182	T	6	6	8902	8907	0 %	100 %	0 %	0 %	444324424
146	NC_020182	GCA	2	6	8968	8973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
147	NC_020182	CAG	2	6	8981	8986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
148	NC_020182	ACTC	2	8	9009	9016	25 %	25 %	0 %	50 %	444324424
149	NC_020182	CACAA	2	10	9022	9031	60 %	0 %	0 %	40 %	444324424
150	NC_020182	GCA	2	6	9051	9056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444324424
151	NC_020182	A	6	6	9071	9076	100 %	0 %	0 %	0 %	444324424

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.